Инфраструктура
На данный момент ЦОД СГК ИЦиГ СО РАН имеет в своем составе:
Четыре вычислительных SMP сервера с общим количеством 150 вычислительных ядер , объемом оперативной памяти 3.128 Тб на безе:
-
Сервер Supermicro AS-2042G-6RF [ 4 x AMD Opteron(tm) Processor 6278; 1Tb DDR3; 5 x 4Tb SAS HDD; 1Tb SATA HDD; 2 x 1GbE; 2 x 10GbE];
-
Сервер Dell PowerEdge 730dx [ 2 x Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2690 v4 @ 2.60GHz; 1Tb DDR4; 4 x 1GbE; 2 x 10 GbE; 1Tb HDD ; 4 x 6Tb HDD; 2 x 446Gb SSD ]
-
Сервер высокой плотности Huawei XH620 4U8 [2 x Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2690 v4 @ 2.60GHz; 128Gb DDR4; 2 x 1GbE; 2 x 10 GbE; 300GBx2 HDD]
-
Сервер РСК Бриз RSC BS R208 в составе: 2 x Intel Xeon Platinum 8268 (2,9 GHz, 24c, DDR4, 205 W), 12 x 32Gb DDR4 ECC Reg, 4 x 4Tb NVMe SSD Intel P4510, 2 x 375Gb NVMe SSD Intel Optane DC P4800X, лицензия IMDT 2 шт., 10 Gigabit Ethernet 2 порта SFP+
Система хранения, распределенная по пяти узлам:
-
Дисковая полка Etegro Fastor JS300 G3 [ 60x 4Tb SAS HDD ]; управляющий сервер Etegro RS 130 G4. Общий объем доступного дискового пространства – 144Тб, на данный момент распределено порядка 100Тб, данными занято порядка 60Тб
-
Дисковая полка Huawei OceanStor 2200 V3 Общий объем доступного дискового пространства 143 Тб, на данный момент распределено 100Тб, данными занято порядка 50Тб
-
Дисковая полка Huawei OceanStor 5300 V3. Общий объем доступного дискового пространства 20Тб, занято данными 10Тб
-
Дисковая полка HP D2700. Общий объем доступного дискового пространства – 8Тб, данными занято 1Тб
-
Ленточная система хранения HP MSL 4048 — общий объем 46 кассет по 2Тб . В настоящий момент находится в процессе ввода в эксплуатацию.
Система виртуализации на базе XCP-NG Xen Server в составе:
-
Сервер HP DL 380 G6 (2 х Intel 5580; 198Gb RAM )
-
Сервер HP DL 360 G6 (2 х Intel 5560; 198Gb RAM )
-
Сервер HP DL 360 G6 (2 х Intel 5560; 48Gb RAM )
-
Сервер Huawei XH620 4U8 [ 2 x Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2690 v4; 128Gb RAM ]
-
Сервер Huawei XH620 4U8 [ 2 x Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2690 v4; 128Gb RAM ]
Система бесперебойного питания в составе: ИБП Huawei UPS5000-E 25kVa с резервированием N+1. Резервная система питания в составе дизель генераторной установки мощностью 100 кВт.
Система климат-контроля в составе двух промышленных кондиционеров канального типа Kentatsu, мощностью 22.5 кВт каждый.
Основная задача, стоящая перед ЦКП «Биоинформатика» — обеспечение вычислительными ресурсами, консультативной, технической и научно-вспомогательной поддержкой деятельность ФИЦ ИЦиГ СО РАН. А именно:
- Решение научных задач в области компьютерной геномики, транскриптомики, протеомики, молекулярной динамики, численного моделирования и системной биологии для отдела системной биологии и других научных подразделений ИЦиГ СО РАН
- Обеспечение вычислительными ресурсами и доступа к ПО для сотрудников ИЦиГ СО РАН, которые готовы сами обрабатывать данные.
- Обеспечение поддержки Web-ресурсов ИЦиГ СО РАН, как созданных отделом системной биологии, так и другими подразделениями.
- Разработка и создание баз данных а области биоинформатики
- Обеспечение вычислительными ресурсами и тех. поддержкой деятельности административных и вспомогательных подразделений ИЦиГ СО РАН (бухгалтерия, IT-отдел и т.д.)
- Обеспечение выполнения больших институтских проектов.
- Взаимодействие и сотрудничество с организациями ННЦ (НГУ, ИВМиМГ, ИЯФ, ИВТ) и за его пределами, для обеспечения решения задач ИЦиГ СО РАН в области биоинформатики.
- Осуществление поддержки образовательной деятельности, проведение практических курсов при поддержке ЦКП
Логическая организация вычислительных ресурсов ЦОД выглядит следующим образом:
- Пул серверов для высокопроизводительных вычислений
- Пул серверов системы хранения.
В свою очередь система хранения подразделяется на:
-
Высоконагруженное оперативное хранилище для высокоскоростного параллельного доступа – обеспечивает поток «горячих» данных для вычислительных программ на сервера HPC.
-
Оперативное хранилище для системы виртуализации — предназначено для развертывания активных образов виртуальных машин
-
Хранилище данных общего назначения – предназначено для хранения «теплых» и «холодных» пользовательских данных, хранения backup – данных.
-
Архивное хранилище на базе ленточных систем – предназначено для хранения данных долговременных неизменяемых архивов.