ЦКП "Биоинформатика"
Основная страница / Работа с кластером / Вход в систему

Вход в систему

На данный момент кластер находится в бета-режиме. Материал будет дополняться

В случае проблемы Вы можете написать письмо (ссылка)

Доступ к кластеру ЦКП “Биоинформатика” предоставляется по двум протоколам:

  • SSH - консольный доступ к кластеру
  • SFTP - синхронизация данных между кластером и пользователем

Адрес кластера

Адрес: gate1.cytogen.ru

Порт: 8035

Логин/пароль заводит системный администратор ЦКП “Биоинформатика”.

Для сотрудников ИЦиГ СО РАН

Если у вас уже есть логин/пароль для входа в smp1-4, то с этим же логин/паролем можно зайти и на кластер.

Инструкция по подключению к кластеру по SSH

Установка ПО и профиля подключения:

  1. Для начала нужно установить PuTTY, перейдя по этой ссылке и установить локально

  2. После установки запустите PuTTY

  3. В поле Host Name (or IP address) нужно набрать: <user>@gate1.cytogen.ru, где <user> - логин пользователя

  4. В поле Port указать 8035

  5. В графе Connection Type убедиться, что стоит галочка на SSH

  6. Далее нужно создать профиль подключения. В поле под текстом Saved Sessions нужно написать имя профиля, например, slurm_icg

  7. Далее нажать на Save

Вы должны увидель следующее в PuTTY

PuTTY example

Чтобы зайти в кластер, нужно выполнить следующее:

  1. Открыть PuTTY

  2. Нажать на созданный профиль подключения к кластеру

  3. Нажать на Load. Вы увидите, что заполнились поля Host Name, Port и возможно другие

  4. Нажать на Open внизу окна приложения. Если вы получите такое же окно, как и снизу, набирайте свой пароль, затем клавишу Enter. Если пароль окжется правильным, вы получите терминал кластера (стандартный интерпретатор командной строки – bash)

PuTTY password

Вся работа в Linux будет в терминале

  1. Для начала нужно установить ssh, например:
$ # For Ubuntu/Linux Mint/Debian
$ sudo apt-get install openssh-client
$ # For ArchLinux/Manjaro
$ sudo pacman -S ssh
  1. Добавьте профиль в конце файла ~/.ssh/config, текст примерно следующий (в строках с отступами в начале строки используется табуляция, клавиша Tab)
Host slurm_icg
	HostName gate1.cytogen.ru
	port 8035
	User <user>

где <user> - логин пользователя

Для подключения к кластеру нужно в терминале выполнить

ssh slurm_icg

Далее - набрать пароль и если он подходит - вы получите терминал кластера

Инструкция по обмену данных с кластером по SFTP

Перед отправкой данных пользователь должен ознакомиться с правилами хранения данных на кластере

  1. Установите WinSCP (https://winscp.net/eng/download.php)

  1. Использовать scp slurm_icg:<путь на удаленной машине> <локальный путь>, чтобы скачать из кластера файл или scp <локальный путь> slurm_icg:<путь на удаленной машине>, чтобы отправить файлы на кластер